El proceso clínico es una intervención correctora de la patología del sujeto enfermo para alcanzar la integración-salud-armonía.

Comienza con un diagnóstico, para conocer la estructura del sujeto, los componentes de la misma, su funcionalidad, su origen y sus pautas de interacción en los sistemas del mundo.

El diagnóstico conduce a un plan terapéutico, que requiere contemplar: los objetivos, el grado de profundización (regresión), la duración, las vías más adecuadas para movilizar el material para favorecer la integración en cada sujeto...

El proceso es único para cada sujeto, solo se conoce el inicio y se sabe hacia donde se quiere llegar: al conocimiento (sophia) del oro alquímico o piedra filosofal, (conciencia despierta en todos los planos de la existencia humana).Un ritmo propio, de pulsación orgonómica, único, para cada sujeto, que uno encuentra (o a uno se le revela) tras un duro camino iniciático en el misterio. 

Se focaliza la atención en la conciencia para poner en marcha los ingredientes necesarios (energéticos; emocionales; biológicos; psicológicos, psíquicos) para que el "material", se pueda cocer de buena forma, observando el proceso con paciencia (contracción) hasta el momento en que se produzca "el contacto" con el propio ritmo interno, con el punto de equilibrio donde todos los planos están armonizados, a partir del cual la conciencia se "expande" con lucidez.

El método es equiparable a un trabajo alquímico, de transmutación de la materia mediante el recurso de la energía vital y sus leyes, .. El cuerpo es el "atanor" continente y, a su vez, contenido, en el que sucede el proceso de transformación. Del trabajo con la materia (actings, imaginación activa, trabajo con los sueños...) se libera el espíritu retenido en ella, "energía vital" que se presenta de modos diversos de información (representaciones simbólicas, emociones, sentimientos, recuerdos,...). Confrontando con esas informaciones el consciente va integrando los diversos ingredientes de la historia de la caracterialidad trascendiéndola y mutando de un nivel de carácter-sombra, a un nivel de yo-luz, en un proceso dialéctico que se puede representar por una espiral.

El proceso es más o menos largo, tiene unas fases en las que se abordan e integran las dimensiones humanas, con un orden, que implica primero un desorden más o menos caótico de la estructura previa. Se experimentan diversos estados de muerte-renacimiento, hasta poder llegar a la "desidentificación" con el propio yo construido.